Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms