Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PLNP26678 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms