Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms