Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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