Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF1P22415 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF1P22415 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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