Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNA2P20248 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms