Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT4P19013 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT4P19013 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT4P19013 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms