Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF3P18847 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms