Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms