Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms