Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms