Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf47O95873 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C6orf47O95873 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf47O95873 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms