Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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