Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms