Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms