Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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