Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms