Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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