Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms