Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms