Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms