Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC180Q9P1Z9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms