Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms