Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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