Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A1Q9NWF4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms