Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPIFA1Q9NP55 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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