Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ROPN1Q9HAT0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ROPN1Q9HAT0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms