Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.2 ms