Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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AMBRA1Q9C0C7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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AMBRA1Q9C0C7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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AMBRA1Q9C0C7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMBRA1Q9C0C7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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AMBRA1Q9C0C7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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