Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms