Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms