Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms