Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms