Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BBS2Q9BXC9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms