Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA16Q9BXB7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms