Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms