Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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