Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms