Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms