Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms