Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms