Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms