Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms