Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms