Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms