Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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GTF3C6Q969F1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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GTF3C6Q969F1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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GTF3C6Q969F1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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GTF3C6Q969F1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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GTF3C6Q969F1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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GTF3C6Q969F1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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