Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP13Q92995 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP13Q92995 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP13Q92995 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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