Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2Q8WZ74 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms