Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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COPS9Q8WXC6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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