Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLEC4CQ8WTT0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4CQ8WTT0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms